1、由于脫粒機工作環境非常惡劣，因此事先要對參加作業的人員進行安全操作教育，使其明白操作規程和安全常識，如衣袖要扎緊、應戴口罩和防護眼鏡等。
2、使用前必須認真檢查轉動部位是否靈活無碰撞，調節機構是否正常，安全設施是否齊全有效；要確保機內無雜物，各潤滑部位要加注潤滑油。
3、開機前應清理作業場地，不得放一些與脫粒無關的雜物；要禁止兒童在場地邊上玩耍，以免發生事故。
4、工作時玉米棒喂入要均勻，嚴防石塊、木棍和其它硬物喂入機內。
5、傳動皮帶的接頭要牢固；嚴禁在機器運轉時摘掛皮帶或將任何物體接觸傳動部位。
6、配套動力與脫粒機之間的傳動比要符合要求，以免因脫粒機轉速過高，振動劇烈，使零件損壞或緊固件松動而引發人身傷害事故。
7、不能連續作業時間過長，一般工作8小時左右要停機檢查、調整和潤滑，以防摩擦嚴重導致磨損、發熱或變形。
8、全自動脫粒機一般都用柴油機作動力，應在排氣管上戴防火罩，防止火災。
9、全自動玉米脫粒機在作業過程中如出故障，應停機后再進行維修和調整。
